有害藻華對生態環境和人體健康存在巨大威脅，目前對有害藻華的監測方法依然以傳統形態學鑒定為主，而已被廣泛用于揭示浮游生物多樣性的環境DNA技術為有害藻華（HAB）監測提供了新思路。研究選取了西班牙西北部的Ria de Vigo淺海區域，連續3年收集沉積物和浮游生物樣本，借助環境DNA技術同時檢測IOC-UNESCO《有害微藻分類參考名錄》中的25種潛在有害物種。

世界性大河對于實現新的全球生物多樣性框架的目標至關重要，迫切需要形成快速準確的生物監測策略。環境DNA（eDNA）技術已被廣泛用于淡水生態監測。然而，世界性大河如長江中下游橫斷面超過1千米寬，深度可達數十米，其適用性仍需深入研究。

中國環境科學學會發布了新年（2023年）第1-3號標準公告，公布了環境DNA（Environmental DNA，eDNA）生物監測與評估的3項技術標準，于2023年1月4日起正式實施，具體包括：1）《淡水生物DNA條形碼構建技術規程》（T/CSES 80—2023）2）《淡水生物監測 環境DNA宏條形碼法》（T/CSES 81—2023）3）《基于環境DNA的淡水生物評價技術指南》（T/CSES 82—2023），該標準體系于2020年立項建設，由南京大學作為牽頭單位，中國環境監測總站、江蘇省環境監測中心、浙江省生態環境監測中心、河南省生態環境監測和安全中心、中國環境科學研究院、昆明學院和南京易基諾環保科技有限公司為參與單位共同編制。

國際上《拉姆薩爾濕地公約》已將2400多個濕地列入國際重要濕地名錄，總面積超過250萬平方公里。公約以“濕地保護”和“明智利用”（wise use）為原則概述了若干戰略與決議，包括“濕地清查與評估”、“全球濕地信息”、“濕地科學管理”、“濕地恢復”、“外來入侵物種控制”等。我國于2022年6月1日實施《中華人民共和國濕地保護法》（簡稱《濕地保護法》），使得維護濕地生態功能及生物多樣性有了確切的法律依據。

地下水是物理意義上最大的淡水生態系統，但是因為缺乏相應的監測方法，地下水系統也是地球上被探索最少的棲息地之一。本研究基于雙重方法，探索了地下水的生物多樣性。首先，使用公民科學與市政供水商合作，在春季使用流域箱進行采樣（地下水生物）和DNA條形碼檢測。其次，在每個地點收集4組10L水樣用于環境DNA（eDNA）檢測。通過兩種方法的結合發現，不同的端足目物種對應著環境DNA數據集的不同序列，且端足目動物的多樣性與各地點地下水生物多樣性之間存在明顯相關性。